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基质性角膜炎是指角膜基质内的非化脓性炎症，角膜上皮以及浅基质层一般不受影响，不会形成角膜溃疡，虽然病程漫长，预后一般是好的。

基质性角膜炎虽然可以因为致病微生物直接侵犯角膜基质引起，但是多数是一种抗原抗体反应，是微生物抗原与血液循环抗体在角膜基质内发生的免疫反应，如先天性梅毒性角膜基质炎，表现角膜基质水肿、淋巴细胞浸润并且常有深层新生血管形成。结核杆菌、单纯疱疹病毒、带状疱疹病毒等感染是常见原因。

基质性角膜炎一般表现眼部疼痛、流泪、畏光、视力下降等，伴有眼睑痉挛、水样眼屎等。角膜基质水肿混浊，单纯疱疹病毒引起的以盘状角膜炎，其它免疫相关性基质角膜炎多从角膜周边开始浸润，逐渐向角膜中央发展，角膜深层新生血管如毛刷状。角膜后可见沉着物，严重的发生前房积脓、虹膜睫状体炎等。角膜基质混浊随着炎症消退会改善，一般会遗留薄的角膜疤痕。具体角膜病变因为原因不同临床表现有区别。

角膜基质炎通过临床表现以及有关的眼科特检如角膜共焦显微镜检查和实验室一般会明确诊断。基质性角膜炎除对因对症治疗外，一般使用糖皮质激素眼药水如泼尼松龙眼药水、非甾体抗炎药物如普拉洛芬眼药水治疗。累及虹膜睫状体，需要散瞳孔眼药水如托比酰胺等治疗。可以考虑中医中药治疗。基质性角膜炎后期严重影响视力可以考虑角膜移植手术治疗。