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真菌性角膜炎是一种由致病真菌引起的致盲性极高的感染性角膜病变。本病发生有明显的致病危险因素，如植物性眼角膜外伤史，如树枝、玉米叶、蔬菜叶、稻草、甘蔗叶等，有的是长期持续使用糖皮质激素或者抗生素滴眼液，有的是眼表疾病或者糖尿病等免疫力低下患者。角膜病变起病缓慢，亚急性经过，怕光流泪疼痛不适症状较轻，角膜病灶呈现牙膏样或者苔垢样外观，其周围可见免疫环，有的可见伪足或者卫星灶，前房积脓、角膜内皮斑等有助于明确诊断。实验室检查如刮片、培养、角膜共焦显微镜检查为诊断提供客观依据。

真菌性角膜炎容易与下列角膜炎混淆，注意鉴别，避免误诊误治。

细菌性角膜炎，发病急，一般是在角膜损伤一天到两天发病，怕光流泪疼痛眼睑痉挛等刺激症状严重，可以有大量脓性分泌物。角膜病灶黄白色浸润，边界模糊，周围组织水肿，溃疡底部污浊其表面常有坏死组织覆盖，不积极治疗可以很快导致角膜溃疡穿孔，抗生素滴眼液治疗效果明显。

单纯疱疹性角膜炎，反复发作的病史和典型的临床表现，一般诊断不困难。发病前多有感冒、发烧、疲劳、外伤、精神压力大等有关。角膜树枝状或者地图状改变有助于明确诊断。根据病变累及的深度可分为上皮型、基质型、内皮型、神经营养不良型。

棘阿米巴原虫感染引起的角膜炎，常因角膜接触棘阿米巴原虫污染的水源，特别是污染的隐形眼镜。病程漫长，长达数月，疼痛症状明显，放射性角膜神经炎是典型体征，涂片刮片、角膜共焦显微镜检查可见包囊。