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先天性瞳孔小，一般是先天性疾病，属于遗传性疾病。主要是虹膜开大肌发育异常导致，虹膜开大肌不发育或者发育不完善，导致功能障碍，使得瞳孔不能开大，显得虹膜括约肌功能相对增强，出现瞳孔小。此类疾病可能伴有小眼球小角膜，甚至视网膜发育异常。需要早发现早治疗，根据病情决定选择适宜方法治疗。

先天性瞳孔小，不影响视力发育，观察就可以，影响视力发育，可以考虑使用散瞳孔眼药水治疗，可以使用低浓度的散瞳孔眼药水，如0.01%阿托品眼药水治疗看看。可以使用短效托比酰胺眼药水等治疗。散瞳孔眼药水使得瞳孔括约肌麻痹，瞳孔就可以开大，使用散瞳孔眼药水治疗，需要遵从医嘱治疗，定期眼科检查确保眼睛安全。可能会出现眼睛怕光不适。

先天性瞳孔小严重的影响视力，可以考虑手术治疗，切除部分虹膜使瞳孔扩大。手术治疗瞳孔小，需要严格的眼科检查，根据病情决定选择，需要慎重从事。

先天性瞳孔小，伴有其它眼部先天异常的，也需要对症治疗。伴有小眼球者，需要验光复光看看度数，配戴合适眼镜，防止弱视发生。一旦存在弱视，需要早发现早治疗，框架眼镜是首选，可以使用隐形眼镜。

先天性瞳孔小合并瞳孔残膜者可以考虑激光治疗将瞳孔残膜打断，也可以考虑手术治疗将瞳孔残膜切除。