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角膜分为五层，即角膜上皮层、前弹力层、基质层、后弹力层、内皮层。基质性角膜炎是指角膜基质层的非溃疡性和非化脓性炎症。

基质性角膜炎可能是与细菌、病毒、寄生虫感染有关，梅毒螺旋体、结核杆菌和单纯疱疹病毒等是最常见的病因。发病机理一般是致病微生物虽然可以直接侵犯角膜基质引起炎症反应，但是多数是由于感染原所致的免疫反应性炎症。属于迟发性变态反应、细胞免疫反应，即机体第一次接触致敏原后，使T淋巴细胞致敏，角膜处于致敏状态，当第二次感染致敏原时，产生淋巴因子，如淋巴毒素、发炎因子、趋化因子等，使角膜基质发生炎症侵润，包括淋巴细胞侵润、单核细胞侵润、基质渗出水肿、细胞变性等。可以导致角膜新生血管形成，可以累及后弹力层以及角膜内皮细胞发生病变。

单纯疱疹病毒性角膜基质炎一般分为坏死性和免疫性角膜基质炎。免疫性盘状角膜炎以角膜中央圆形水肿侵润，灰白色可以伴有后弹力层皱褶和角膜内皮损伤。病程漫长，侵润水肿吸收可以遗留角膜疤痕。一般使用阿昔洛韦眼药水或更昔洛韦眼用凝胶，糖皮质激素药物如泼尼松龙眼药水、非甾体抗炎药物如普拉洛芬眼药水治疗，可以考虑中医中药治疗。

相关性免疫性角膜基质炎，一般从角膜缘开始，逐渐侵润角膜基质层，由周围角膜向中央角膜侵润，角膜基质水肿混浊，可以形成浅层或者深层角膜新生血管，病程缠绵漫长，痊愈后一般会遗留角膜疤痕，对因对症治疗是关键，可以使用泼尼松龙眼药水，普拉洛芬眼药水治疗，根据病情决定个性化治疗方案才行。