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慢性肾盂肾炎是由于反复发作或者是持续存在的肾脏感染所引起的肾损伤。慢性泌尿系统的感染，患者可出现肾盂，输尿管粘膜，肾盏和肾间质纤维化瘢痕变形。这种慢性感染多见于泌尿系统有解剖异常的患者，包括膀胱输尿管返流尿道梗阻或肾发育不良，或者是输尿管发育不良导致的输尿管卷曲弯曲。

反复的尿路感染和可能存在的膀胱，输尿管反流是肾盂肾炎发病的重要关键因素。

膀胱输尿管返流根据其病因可分为原发性和继发性。

原发性膀胱输尿管反流比较常见。是由于膀胱黏膜下输尿管段的先天发育异常所导致。一般随着儿童的成长膀胱壁段输尿管长度会延长，输尿管扩音机的功能改善，因此部分膀胱输尿管返流的儿童随生长发育会自动消退。但成人膀胱输尿管反流无自然停止的可能。

继发性膀胱输尿管返流可见于：炎症，如结核感染。尿道梗阻神经源性膀胱。外科手术导致的输尿管开口处损伤。脊髓损伤，妊娠，肾移植术后。

膀胱输尿管反流导致的肾脏损伤，可表现为肾脏缩小，肾盂肾盏扩张，肾皮质变薄，肾脏表面有局灶性瘢痕形成。是临床导致单侧肾脏缩小最常见的原因。

慢性肾盂肾炎临床表现：

一尿路感染。病人常有持续的尿急，尿频尿痛，严重者可表现为典型的急性肾盂肾炎。

二蛋白尿。多见于慢性肾盂肾炎数年后，这项指标提示预后不良。

三高血压。随着肾脏瘢痕的进展，肾素血管紧张素产生增多，合并高血压的危险性增大。