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在临床上甲状腺功能亢进危象出现的症状与很多疾病相似，这时为了避免误诊需要进行鉴别，而对于如何进行鉴别诊断，大致有以下几个方面。

第一，与败血症相鉴别，甲亢危象与败血症的患者都会出现高热，但是甲亢危象的患者一般是持续性的高热，同时还会有出汗量较大的特征，很典型的特点是脉率增快比体温升高更明显，同时还会表现为甲亢其他的征像，而败血症的患者与之不同，仅仅表现为高，一般应用物理降温或者抗感染治疗效果明显，在甲亢危象的患者应用抗生素效果不佳。

第二，与心血管系统疾病相鉴别，甲亢危象出现的心血管症状与很多心血管疾病症状都相似，同时甲亢危象也会导致严重的心血管疾病，临床上甲亢危象应该与冠心病、心律失常、心房纤颤、房扑等心血管疾病相鉴别，心血管疾病的患者仅仅会出现相关的心血管症状，并没有伴随甲亢的症状，而甲亢危象的心血管症状同时伴有甲亢相关症状，常规的按照心血管疾病的方法进行治疗一般效果不佳，需要抗甲亢的同时应用普萘洛尔等药物控制心率。

第三，其他疾病相鉴别，比如甲亢危象的患者会出现呕吐、腹泻，这时也应该与急性胃肠炎想鉴别，甲亢危象的患者出现腹泻以便糖为主，腹痛并不明显，而急性胃肠炎的患者腹痛比较明显，通过大便常规检查也可以进行鉴别，对于甲亢危象昏迷的患者还需要与肝性脑病、休克、心源性猝死等疾病进行鉴别。