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医生如怀疑或排查患者是否存在卵圆孔未闭，通常会完善以下检查。


心脏超声
由于超声心动图可以直观地显示房间隔解剖结构及心脏内血流分流情况，因此超声心动图是卵圆孔未闭的最佳诊断检查。
临床上常用的超声心动图包括经胸超声心动图（TTE）、经食管超声心动图（TEE）和经颅多普勒超声声学造影（cTCD）。

经胸超声心动图（TTE）
性价比高，操作简单、无痛苦，但该检查会受到肥胖和肺气过多等因素的干扰，检出率不高，且难以准确测量未闭的卵圆孔大小，一般应用于儿童及部分成年人。
经胸超声心动图声学造影（cTTE）可以提高检出率，了解患者有无心脏内血液异常分流。操作时需要静脉注射声学造影剂。


经食管超声心动图（TEE）

是诊断卵圆孔未闭的“金标准”和首选方法。

该检查可以指导医生对卵圆孔未闭进行分类，从而指导治疗。
该检查属于半创伤性检查，操作过程中患者比较痛苦，类似于胃镜检查，插管会造成患者恶心、呕吐等不适。检查前后患者须禁食、禁水。

经食管超声心动图声学造影（cTEE）亦可用于判断心脏内血液异常分流情况。
此外，三维经食管超声心动图（三维TEE）能够为二维TEE图像提供有力补充，帮助医生了解实时未闭卵圆孔的状态，更有利于指导治疗。

经颅多普勒超声声学造影（cTCD）
简单、无创、安全。检查心脏内血液有无分流的一种常用方法，但是不能定性诊断卵圆孔未闭。作为卵圆孔未闭筛查的一种方法，通常需要进一步进行经胸超声心动图（TTE）、经食管超声心动图（TEE）等检查作为补充。

其他检查
心导管检查、对比分析双源CT冠状动脉成像和心脏磁共振成像（MRI）可以发现卵圆孔未闭，但费用较高，敏感性相对较差，临床较为少用。