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亚临床甲减是临床上非常常见的甲状腺疾病，亚临床甲减发生的原因也比较复杂，与很多因素有关，人体很多结构或功能发生了异常就会引起甲状腺激素合成障碍，最终引发亚临床甲状腺功能减退或者临床甲状腺功能减退的发生，而对于亚临床甲减的病因具体有以下几个方面：

第一，原发的亚临床甲状腺功能减退，约占总体比率的90%以上，其他的情况是少见的，主要是以慢性淋巴细胞性甲状腺炎最为常见，有的患者会伴有甲状腺肿大，而有的患者就不会，原发性亚甲减的病因又可以分为甲状腺不肿大，甲状腺先天发育异常，有家族史或者特发性，还有的就是因为放射性碘131治疗或甲状腺切除术后进行治疗，头颈部肿瘤的放射治疗也会导致亚甲减的发生。

第二，环境因素，对于甲状腺肿大的原因主要是甲状腺激素合成障碍，碘缺乏是导致甲状腺功能减退的原因，亚临床甲减与碘缺乏也是有密切关系的，比如由于母体内的碘化物或者抗氧化剂传递给胎儿致病就是原因，地区性的摄入碘缺乏或者经常吃一些能够导致甲状腺肿的食物，像木薯，卷心菜，菜花等等，都是导致亚临床甲减的主要原因。

第三，药物性的致病因素，很多药物会导致甲减的发生，亚甲减也会因为药物的过量而出现，比如抗甲亢药物的过量，或者碘化物保泰松以及锂盐等等。另外，垂体性的甲状腺功能减退也是一种原因，主要是垂体疾病会使tsh分泌减少而出现的。