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临床上单纯性甲状腺肿往往甲状腺功能正常，但甲状腺却出现肿大，与缺碘以及食用致甲状腺肿的食物和相关酶缺乏等因素有关，只是单纯代偿性的甲状腺肿，并没有甲状腺功能减退或者甲状腺功能亢进的发生，当然也有很多甲状腺疾病与单纯性甲状腺肿容易混淆，临床上需要我们进行鉴别，大致有以下几个方面。

第一，与甲状腺功能亢进症相鉴别，甲状腺功能亢进症也会出现甲状腺肿大，这与单纯性甲状腺肿患者出现的代偿性肿大容易混淆，都有可能会呈弥漫性的甲状腺肿大，但是甲亢的患者会有甲亢的症状，而单纯性甲状腺肿却没有甲亢的症状，其中甲亢的症状包括代谢亢进、食欲增加、怕热多汗、烦躁易怒、眼球突出、精神亢奋、身体消瘦等症状。

第二，与桥本氏甲状腺炎的甲状腺肿相鉴别，桥本氏甲状腺炎的甲状腺肿与单纯性甲状腺肿是有一定区别的，桥本氏甲状腺炎患者甲状腺的肿大以双侧或者单侧弥漫性小结节状或者巨块状肿块为主，而单纯性甲状腺肿是弥漫性为主，通过触诊可以鉴别，当然也可以通过甲状腺功能以及抗体的检查进行区分，桥本氏病的患者TPOAb、TgAb皆为阳性。

第三，与甲状腺癌相鉴别，甲状腺癌是甲状腺疾病比较严重的一种情况，这与单纯性甲状腺肿有一定的区别，甲状腺癌的患者往往呈单发性或者多发性的肿块、质地非常坚硬、常常伴有周围淋巴结肿大，血清学的检查可见降钙素水平升高，而单纯性甲状腺肿血清学一般没有变化，通过甲状腺细针穿刺的病理学检查也可以进行区别。