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小儿结节性甲状腺肿在临床上比较常见，是以结节性甲状腺肿为主要表现，而小儿结节性甲状腺肿在临床上也是应该进行鉴别诊断的，有一些疾病容易和小儿结节性甲状腺肿相混淆，具体的鉴别诊断分为以下几个方面。

第一，与甲状腺肿瘤相鉴别，甲状腺肿瘤包括良性的甲状腺肿瘤和恶性的甲状腺肿瘤，小儿结节性甲状腺肿应该与良恶性肿瘤区别，良性肿瘤与小儿结节性甲状腺肿很难鉴别，临床上需要通过甲状腺彩超以及甲状腺细针穿刺细胞学检查进行区分，甲状腺肿瘤一般较为严重，有的可能会出现近端转移，淋巴结转移，甚至远端转移等。在临床上需要结合甲状腺自身抗体测定、降钙素的测定、甲状腺核素显像等方法进行鉴别。

第二，与颈部畸胎瘤进行鉴别，颈部畸胎瘤经常位于甲状腺当中，这种畸胎瘤有时会被误认为是小儿结节性甲状腺肿，儿童时期容易发生颈部畸胎瘤并且颈部肌胎瘤的发生与小儿结节性甲状腺肿极为相似，同样会出现压迫气管和食管的症状，患儿也会出现呼吸困难、声音嘶哑等情况，进行甲状腺彩超以及甲状腺细针穿刺做病理学检查进行区分有很重要的意义，避免误诊而错误的进行治疗，需要有经验的医生详细的诊断。

总结，小儿结节性甲状腺肿，不单单与以上两种疾病需要相鉴别，还需要与小儿甲亢、小儿甲状腺炎、小儿单纯性甲状腺肿以及小儿其他甲状腺疾病相鉴别，综合的分析，避免误诊，最终采取对症治疗的措施。