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女性的孕期用药是一个更加敏感、更应该引起注意的问题。由于一些药物可以通过胎盘屏障进入胎儿的体内，所以有可能影响胎儿的正常发育，这一点目前已引起人们的高度重视。但是有一些孕妇为了保证不用药，即使生病也不去治疗，这种观念是错误的。对很多疾病来说，如果不加治疗，不仅对孕妇不利，对胎儿本身也有很大危害的。

许多准妈妈会担心药物对胎儿产生致畸作用，其实除去致畸作用之外，药物对胎儿的风险还有多种类型，包括可能增加流产的概率，或者可能造成出生时低体重等等。一些准妈妈在早孕期还不知道自己已经怀孕的时候，可能使用了一些药物，因为担心药物会影响宝宝发育或者是造成畸形，许多准妈妈都选择了人工流产来终止妊娠，但其中有很大比例是没有必要的。

通常来说，在怀孕的头4周内 ，胚胎还没有分化成各种组织和器官，具有多向分化潜能。胚胎在这一时期受到药物的作用，如果胚胎轻度受损，尚能"自我修复"，则继续正常生长；如果胚胎严重受损，无法继续发育，则发生自然流产。

在受孕的第5周到3个月期间 ，胚胎开始分化出不同的系统和器官，这时有些药物就有可能对器官发育产生影响了。药物对胎儿可能的影响主要分成两个方面。有一些药物可以直接进入胎儿体内，对胎儿的发育产生直接的作用。还有一些药物对胎儿的发育没有直接的作用，但是可以影响母体或胎盘，对胎儿的生长发育造成间接的影响。