习惯性流产的原因有: 1、内分泌异常。如黄体功能不足、甲状腺功能亢进或低下、糖尿病等。这些病变影响蜕膜、胎盘和胎儿的发育,可能导致流产。2、母婴血型不合。母儿血型不合，主要有ABO型和Rh型两大类。初次怀孕对胎儿影响不大，分娩次数越多，胎儿、新生儿发病的可能性越大，因此，常在第二胎以后发病。此类血型不合的病情重，可常见流产、死产、严重的新生儿溶血性黄疸等。3、感染性因素。孕期感染细菌或病毒等病原体，患急性病、高热、细菌毒素或病毒(单纯疱疹病毒、巨细胞病毒等)、严重贫血或心力衰竭、慢性肾炎或高血压、盆腔肿瘤(如子宫肌瘤等)、甲状腺功能减退症、严重糖尿病未能控制均可导致流产。4、孕妇的不良习惯及情绪。不良习惯如过量的吸烟、饮酒和咖啡以及吸毒等。5、环境因素。过多接触某些有害的化学物质(如砷、铅、苯、甲醛、氯丁二烯、氧化乙烯等)和物理因素(如放射线、噪音及高温等)，均可引起流产。6、生殖器官畸形。如双角子宫、单角子宫、纵隔子宫、鞍状子宫等，这类畸形可导致孕早期胚胎着床部位血运不什么原因导致习惯性流产足，影响胚胎发育。7、染色体异常。染色体异常的胚胎多数结局为流产，极少数可能继续发育成胎儿，但出生后也会发生某些功能异常或合并畸形。称为遗传因素，对此夫妇双方可作染色体检查，有条件时可以检查流产物的染色体。
8、男性因素。精子畸形率高、活力低、男性生殖器官的炎症等因素。9、不明原因。尽管医学目前已经比较发达,但仍大约一半的复发性流产无法查出病因。