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肠功能紊乱，病因很多，大多数与精神神经因素，饮食因素，环境刺激因素，及肠道动力学等因素密切相关。多种研究表明，肠道功能紊乱是多种致病因素共同导致的肠道，功能减弱，大便不畅，免疫力低下，合并胆道泌尿系感染，而引发肠道功能紊乱。

肠功能紊乱，分多个亚型，第一个肠易激综合征，第二个功能性腹胀胀气，第三个功能性便秘，第四个功能性腹泻，第五个是非特异，性功能性肠紊乱。

肠功能紊乱的治疗分为一般治疗和药物治疗。

一般治疗，是指通过调节精神神经等因素，通过调节饮食等因素来调整肠道功能紊乱，通常有饮食疗法，营养支持疗法，镇静安眠，解痉止痛等综合疗法，医生也可以根据患者的症状跟体征来使用调节胃肠道的药物维生素为等治疗，对有明显焦虑抑郁症状，精神症状的患者，给予抗焦虑，抗抑郁治疗，解除心理障碍，比如说黛力新疏肝解郁等药物。心理治疗主要是对患者进行耐心的解释，安慰疏导分析，积极暗示情绪转移，让患者真正认识到自己的病情，主动来调节自己的情绪和生活方式，解除患者的顾虑和担心从而治疗。

药物治疗主要的目的是调节患者的神经功能，能够改善患者的睡眠，然后可以选择镇静剂，比如说给患者安定睡眠不好助安眠的药物，谷维素等，然后比如说患者出现了腹痛腹胀的症状和给予抗胆碱能药物，然后来解除平滑肌的痉挛，缓解疼痛，像阿托品若患者出现了恶心呕吐神经性呕吐症状，可给予维生素b6来止吐，若患者出现了神经官能症，功能性便秘，和给予乳果糖和益生菌来通便治疗，若患者是功能性腹泻的症状和给予思密达和益生菌来止泻对症治疗。