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有些疾病从理论上来讲，随着疾病的自限性，加上患者自身抵抗力的作用，是可以自愈的。这样从理论上讲百日咳是一种自限性疾病，需经过漫长时间的剧烈咳嗽，病情有可能会自愈的。

但是由于百日咳此病病程较长，在痉挛期，咳嗽剧烈，咳嗽有独特的特点，呈现阵发性、痉挛性咳嗽，每次咳嗽连续十几声至数十声。咳嗽时面红唇绀，两眼园睁，双手握拳屈曲，身体弯曲，常发出鸡啼样吸气声，咳嗽剧烈时，眼结膜出血、鼻出血，咯血，甚至颅内出血。患儿是比较痛苦。这么严重的咳嗽是必须用药干预对，不能等待自愈的。

因咳嗽剧烈，不但引起上述症状，还可以常使病人疲乏，食欲减退，睡眠不安、营养不良，免疫力下降等等，常合并肺部感染，引起气道高反应造成患儿喘息。还可出现一些并发症，比如出现百日咳脑病。因此，百日咳应给予积极治疗，不要等待。百日咳杆菌就是百日咳感染之后，在诊断清楚之后，通过规范的抗百日咳杆菌的治疗，效果还是比较明显的，治疗时给予对症处理可以减轻患儿痛苦，如果这种疾病只是依靠孩子自身的免疫力，不但增加孩子的痛苦，而且会使疾病加重，出现一系列并发症，引起抽搐，窒息甚至死亡。

所以百日咳杆菌如果高度怀疑的时候，在通过临床的表现及时来判断出来，早期进行治疗。