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新生儿出现营养不良可以有先天的因素，也可以有后天的发育情况而造成的，因此要针对病因进行有效的调整和治疗。
新生儿先天性营养不良因素包括各种肠道的畸形或者是代谢性的疾病。比如先天性的食管闭锁，肠道的重复畸形，先天性的胆道闭锁等等，这些情况都会严重的影响营养成分在肠道内的吸收，所以需要及时的采取手术治疗措施给予纠正，恢复肠道的正常功能以后，合理的喂养才能及时的补充营养。而对于遗传代谢性疾病比如苯丙酮尿症等等，需要采取特殊的饮食控制才能防止营养不良的发生。
而对于各种原因引起的严重的消化不良或者是乳糖不耐受，或者是母乳蛋白过敏等情况下，都会严重的影响蛋白质等营养物质的吸收。因此要给予相应的治疗方案，比如为了防止腹泻的继续发生，可以口服腹泻奶粉等等，另外对于脾胃不和，脾胃虚弱的新生儿可以给予健脾合胃治疗。
另外针对一些后天的继发的引起消化不良的因素，也要给予相应的即时控制原发病缓解并发症的治疗，比如要及时的调整肠道菌群。另外针对一些糖尿病甲亢等消耗性疾病要及时的给予足够的能量补充，防止过度的消耗体内的各种蛋白质尤其是免疫球蛋白。
总之，无论是对何种因素影响机体营养物质吸收的病因病情都要及时的给予控制，在严重缺乏时要及时的给予补充。
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