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抗抑郁剂从诞生到现在已超过30年，从最开始的单胺氧化酶抑制剂类抗抑郁药到现在的单胺类神经递质的抗抑郁剂已有了极大的进步，其安全性方面得到了极大的提升，因此现在临床上所使用的抗抑郁剂都相当安全。
在副作用方面，临床中患者最常担心的是我吃了会不会依赖，会不会吃上这个药后就一辈子需要吃药；第二，服用此类药物后是否会变傻，是否会导致头脑迟钝，像变了一个人，不会悲伤，但也不高兴；第三，服用抗抑郁剂后，是否会对心、肝、肾造成负面影响或永久的毒性，这些顾虑都是非常可理解的。任何患者如果需要长期服用作用于中枢神经系统的药物，他应该有这些顾虑。
但现在的抗抑郁剂在中枢神经系统方面非常安全，不会对患者的认知功能产生持久的影响。相反，抑郁症本身就会导致认知功能的抑制、记忆力下降、注意力涣散等等，而抗抑郁剂改善这些症状的。另外，抗郁剂也不会影响心、肝、肾，也不会造成依赖性。