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耐药肺结核是指结核杆菌对所使用的抗结核药产生耐药的结核分枝杆菌感染。单一药物抗结核治疗，非常容易导致细菌产生耐药突变并存活。所以不完整的疗程以及多变的治疗方案，容易选择出优势耐药菌。在治疗的时候，联合用药就显得特别重要，因为，对一种治疗药物耐药的菌株，可能被另一种药物杀灭。

除了单药耐药，更多的是多耐药结核。多耐药结核，是指体外检测结核分枝杆菌对异烟肼和利福平同时耐药，包括或者不包括对其他抗结核药物耐药的耐药结核。目前，多耐药结核有大量的报道。在过去十年间，全球新发大约70到100万新的多耐药结核患者。在印度和中国这样的发展中国家，多耐药结核是结核防控的最大障碍之一。

更严重的是泛耐药结核，是指多耐药结核患者对氟喹诺酮类药物以及注射制剂（如阿米卡星等等）也耐药的情况。由于氟喹诺酮类药物和注射制剂对于治疗多耐药结核的意义非常重大，所以如果这些药也不能使用的话，泛耐药结核的治疗就显得更加困难，病死率更高，只有极少数患者可以获得痊愈。

耐药结核的治疗，需要根据不同耐药类型而定，总的抗结核治疗疗程必须延长，一般为18-24个月。所采用的方案是：用包括吡嗪酰胺在内的一线药物，加一种氟喹诺酮类药物，以及多种二线药物组成的、有4到5种对结核杆菌敏感或可能敏感的抗结核药物组合。选择药物的时候，也要参考当地的耐药检测、流行病学数据，以及病人的用药史。

耐药结核的治疗非常复杂，药物使用的副作用比较难以处理。治疗方案需要在有经验的结核病专家的指导下制定。同时需要全程督导患者服药，以免因为依从性差而导致新的耐药发生。