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在正常情况下，子宫颈阴道部的粘膜直接与阴道的粘膜相连，都是由复层鳞状上皮组成，而宫颈管是由柱状上皮组成。在宫颈外口处，宫颈阴道部的鳞状上皮与宫颈管的柱状上皮之间有清楚的分界线。有时侯子宫颈管的腺体可以伸展到宫颈粘膜面。假如这些腺体的出口被堵塞，就会形成储留囊肿，也就是宫颈纳氏囊肿。

女性一生中，宫颈的鳞柱状交界的位置并非固定不变，而是在不断变化的。当宫颈发生感染和损伤时，原本位于宫颈外口或其附近的鳞柱状交界却在宫颈表面。由于宫颈这时只覆盖单层柱状上皮，下面的血管基质清晰可见，呈红色，这就是过去所说的宫颈糜烂，现在叫做宫颈柱状上皮外移。通过鳞状上皮化生阴道部的宫颈柱状上皮，逐渐转化成复层鳞状上皮。

鳞柱状交界退缩到宫颈管内膜，宫颈完全有鳞状上皮覆盖。也就是宫颈糜烂愈合的过程中，宫颈管柱状上皮的腺窝闭塞，导致粘液出口堵塞，或者腺管周围组织增生，使腺管狭窄，以致阻塞，腺体分泌物潴留在腺腔内，形成大小不等的囊肿，产生常见的宫颈内纳氏腺囊肿。如果肉眼看到宫颈纳氏腺囊肿，就说明某一时间段，在该区域内，曾有柱状上皮覆盖，目前已发生转化。这种囊肿一般约米粒大小，略突出于宫颈表面，光滑发亮，内含黄白色粘液。也可长大至一厘米直径大小，刺破囊肿可见胶冻状物。宫颈内纳氏囊肿其实就是宫颈炎的一种表现。较小的囊肿，没有什么症状，一般是不需要特殊治疗的。