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小檗碱从中药黄连里提取所得，无论是从临床脂肪肝患者的角度分析，还是在生理及分子的基础研究层面，多项结果已表明小檗碱具有减轻肝细胞脂质沉积的作用。但其改善肝脂沉积这一现象背后的潜在机制，仍有很多未知值得探索。自噬是细胞通过溶酶体降解细胞内容物的过程，通过自噬途径降解脂滴的过程特异性地称作脂质自噬。SIRT1 对肝脏脂质代谢平衡的维持至关重要，它可以通过诱导 FGF21 减轻肝脏脂质变和增强机体能耗水平。SIRT1 是否参与小檗碱改善肝脂代谢紊乱的过程，其重要性及具体分子机制仍未有文献报道。
最新研究发现通过深入的体内和体外研究发现，小檗碱可有效增强肝细胞中的自噬水平，明显改善高脂高蔗糖饮食（HFHS）诱导下肝脏脂质变程度。进一步研究发现，小檗碱诱导肝细胞自噬的作用一定程度上介导了该药物抑制肝脂沉积作用的发挥。在 SIRT1 肝脏特异性敲除（SIRT1 LKO）小鼠模型中小檗碱缓解高脂诱导的肝脏脂质蓄积作用和诱导自噬的作用均被阻断，证明了 SIRT1 在小檗碱增强自噬和抑制肝脂蓄积作用中的重要性。研究还发现，小檗碱可以提高 SIRT1 去乙酰化酶的活性，从而促进自噬相关蛋白 5（Atg5）发生去乙酰化改变。此外，该研究表明小檗碱可促进肝脏生成和分泌 FGF21，增加机体能量消耗水平，SIRT1 同样也在一定程度上参与介导了小檗碱的这一作用，阐明了 SIRT1 在小檗碱改善机体代谢水平中的重要地位。鉴于 FGF21 具有调节白色脂肪棕色化的作用，小檗碱在促进肝脏生成和分泌 FGF21 的同时，脂肪组织中与棕色化和产热相关基因 UCP1、PRDM16、DIO2 的表达水平发生明显上调，表明小檗碱可能通过激活 FGF21 信号通路来增加脂肪组织产热，增加机体能耗，达到体重减轻的效果。