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抗生素是治疗尿路感染最常用的药物，女性尿路感染通常大肠埃希氏菌感染居多，临床上常用左氧氟沙星等喹诺酮类抗生素口服来治疗，急性尿路感染一般服药治疗三天，慢性尿路感染一般服药治疗两周。因滥用抗生素的情况比较普遍，容易导致左氧氟沙星耐药，故在服药前最好进一步检查中段尿细菌培养和药物敏感试验，边治疗边等待检查结果，待三天左右培养结果出来后，再根据药敏结果更换成敏感药物继续抗感染治疗。抗生素治疗的疗程不宜过长，否则容易导致耐药和人体菌群失调继发二重感染，造成尿路真菌感染，需要进一步检查中段尿真菌培养明确后口服氟康唑等抗真菌药物进行治疗。少数患者中段尿培养未发现致病菌，普通抗生素治疗后症状反复发作迁延不愈，还应考虑结核杆菌等特异性尿路感染的可能，明确诊断后需服用异烟肼、利福平、乙胺丁醇、吡嗪酰胺、链霉素等抗痨药长疗程治疗。

女性尿路感染时，还可以口服清热解毒、利湿通淋的中成药，如三金片、宁泌泰胶囊、尿感宁颗粒、复方石韦片、银花泌炎灵片等。可以有效缓解临床症状，缩短治疗的疗程。