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临床治疗乙型肝炎的药物包括抗病毒药物、保肝护肝药物、退黄药物、调节免疫方面的药物等。

乙肝是比较常见的传染性的疾病，目前仍然是临床难治性的疾病，没有成熟的方案可以在短期内将乙肝彻底治愈，但是可以通过有效的治疗，有效的控制疾病的进展，防止出现终末期的肝病。

目前对于乙肝的治疗，最主要的就是进行抗病毒治疗，严格掌握治疗适应症，在达到抗病毒治疗指证以后，进行积极的抗病毒治疗。可以选择干扰素抗病毒治疗，比较常用的有普通干扰素以及聚乙二醇干扰素，另外可以选择口服核苷酸类的药物进行抗病毒治疗，如拉米夫定、阿德福韦酯、替比夫定、替卡韦、替诺福韦等，其中以恩替卡韦和替诺福韦等强效低耐药的药物作为首选。

乙肝活动期大多伴有肝脏的炎症损伤、黄疸的表现，及时的使用一些保肝、退黄的药物进行治疗，如甘草酸制剂、水飞蓟类的保肝药物、还原性谷胱甘肽、多烯磷脂酰胆碱、熊去氧胆酸胶囊、丁二磺酸腺苷蛋氨酸，以及一些中草药、中成药等药物，根据病情适当的选择保肝药物的应用。

调节免疫治疗在乙肝的指标当中也是非常重要的部分，可以选择口服或者静脉使用免疫调节剂进行治疗，如胸腺肽制剂，可以起到协同抗病毒治疗的效果，有利于改善预后，减少终末期肝病，尤其是肝癌的发生率。