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核苷（酸）类似物口服抗乙肝病毒药物的治疗中，HBV DNA阴转后，HBeAg可以仍然（+）。

急性乙型肝炎约95%以上的患者可凭借自身免疫功能清除乙肝病毒，由于HBV DNA在血液中的半衰期短于HBeAg，故HBV DNA阴转后，HBeAg仍可（+）。

在略高于正常临界（cut off）值的阳性结果中，可能就存在假阳性。

如美国FDA批准的乙肝病毒血清学标志物“五项指标”中的HBeAg，正常临界（cut off）值为1.0 S/CO,而＜3.0 S/CO的阳性结果中，就存在假阳性，应引起注意。

此时有可能是处于HBeAg阴性HBV感染的非活动性HBsAg携带状态，HBV DNA可以是阴性。

由于受主观和客观因素的影响，任何检验结果包括乙肝病毒血清学标志物“五项指标”和HBV DNA，都有存在假阳性和假阴性的可能。