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细菌通过以上四个途径进入肛门内部后，还要寻找落脚点，寻找“好欺负”的攻击目标，这些目标就是肛门直肠周围的间隙。所谓间隙就是空间和缝隙，这些地方填充的都是脂肪，被细菌感染后会很快成脓，日久迁延，就会成瘘。肛门和直肠周围主要有八个这样的间隙，每个间隙发病后的特点、转归、预后和治疗方法都有所不同，需要我们去一一了解。
（一）肛周皮下间隙
肛周皮下间隙分布在肛缘皮下，前后左右都有，但发病以后侧和两侧居多，属于最表浅的间隙。感染途径是肛窦和肛缘皮肤。病灶多局限很少向周围蔓延。内口在病灶相对应的齿线位置。手术相对简单。
(二）会阴筋膜下间隙
会阴筋膜下间隙位于肛门前侧，女性较小，男性范围广，一直延伸到阴囊根部。这一部位的间隙分深浅两层。浅层和肛周皮下间隙相通。感染途径是肛门前侧齿线处的肛窦和裂伤的肛管皮肤，所以内口一般也位于此处。发病后如果没有得到及时治疗，往往会向阴囊蔓延。
(三）肛管后间隙
肛管后间隙位于肛门后侧，分深浅两层，浅层和肛周皮下间隙相通。深层通向两侧坐骨直肠窝间隙。感染途径是齿线处后侧肛窦和肛门后侧裂口。内口多在后正中齿线位置。发病后易向两侧蔓延。
(四）坐骨直肠窝间隙
坐骨直肠窝间隙是肛周最大的间隙，左右各一个，并通过肛管后深间隙相通。感染途径基本是肛窦，内口位置有两种可能：一是和病灶相对应位置，二是后正中位置，具体如何判断将在后面相关章节介绍。这两个间隙感染后症状非常严重，会向对侧蔓延，形成马蹄或半马蹄形脓肿。绝大部分复杂肛瘘都是来源于这一部位的脓肿。
(五)括约肌间间隙
括约肌间间隙是指内外括约肌之间，严格讲这一部位没有明显间隙，但这里却是众多肛周感染的原发部位。前面谈到肛窦是细菌人侵肛门的最主要入口，但真正进入肛门内部依靠的是肛腺，而大部分肛腺的腺体位于括约肌之间。细菌往往是先在这里感染，然后再向其他各个间隙扩散蔓延。其内口没有确定部位，但以后正中齿线位为多，蔓延方向也不定。
(六）直肠黏膜下间隙
直肠黏膜下间隙直肠下端黏膜下，前后左右都有，属于高位间隙，细菌人侵途径是肛窦，病灶多局限，也很少向周围蔓延，内口和病灶在同一位置。
(七）直肠后间隙
直肠后问隙位于直肠后侧，是所有间隙中位置最高的。细菌感染途径是肛窦，内口在后正中齿线处，发病后有可能向两侧骨盆直肠间隙蔓延，形成高位马蹄脓肿和肛瘘，临床治疗难度大。
(八）骨盆直肠窝间隙
骨盆直肠窝间隙位于直肠下端的两侧，左右各一，盆底之上、腹膜之下，下面对应的坐骨直肠间隙，属于高位间隙。感染途径是空、内口多位于后正中齿线，发病后有可能借道直肠后间隙向对侧意征，也可能向下蔓延至坐骨直肠间隙。