一对不孕夫妇所检查的各项指标都正常，但是不孕原因又无法解释的时候，可诊断为不明原因的不孕症。依目前的资料显示：不明原因不孕症约占不孕症的10%~26％。其实叫不明原因不孕，实在是一种无奈的命名。因为在这些看似正常的夫妇中，不孕的原因可能是很复杂的。其中一些夫妇确实没什么问题，而不孕只是时间上的延迟，多与年龄有关；而另一些夫妇不孕症检查看似“正常”，却可能存在着潜在的、目前常规检查无法检出和验证的病因。虽然近年来，生殖医学领域的发展非常迅速，但我们对不孕症的检测手段却仍然是如此不敏感。目前我们还没有一个足够确定正常排卵的检查手段；还缺乏一种理想的反映黄体期孕酮水平的实用方法；子宫输卵管造影只能反映输卵管的通畅，而不能预测是否会发生宫外孕；腹腔镜虽能发现盆腔里有轻度的子宫内膜异位症和盆腔粘连，但不能确就是不孕的唯一原因；精液分析能够确定精子的常规指标，但并不能证明其受精能力；即使试管婴儿也不能保证在每个周期完全一致的结局。总之，在男性和女性的受孕过程各个环节中，许多潜在的缺陷，即使是目前最全面的检测，也没有达到足够的敏感度。所以，不明原因不孕并不知病因来自女方或男方。
针对这种情况，治疗上1.诱导排卵 对年轻，卵巢储备功能良好，不孕年限不长的夫妇，可以试行诱导排卵的治疗，推荐药物和方案是来曲唑，或来曲唑+低剂量促性腺激素3~6个周期，以单卵泡发育为目标。2.诱导排卵加宫腔内人工授精 对年龄小于38岁，有3年以上的不孕病史，卵巢功能正常者，推荐诱导排卵加上宫腔内人工授精（IUI）3~6个周期。诱导排卵药物和方案为来曲唑，或来曲唑+低剂量促性腺激素。不明原因不孕症夫妇单行IUI，并不能改善妊娠率，配合使用诱导排卵方案可以增加怀孕机会。资料显示，3个周期的累计怀孕率可达到约35%，比单行IUI或单独促排卵的怀孕率都高。3.体外受精和胚胎移植 如果持续3~6个周期以上的诱导排卵加IUI治疗仍未成功，意味着怀孕已经不很乐观。因此，应考虑采用体外受精（IVF）的治疗计划。不明原因不孕行IVF治疗每周期怀孕率约为35%～40%。