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肛瘘手术有一定的复发几率，没有医生可以保证肛瘘手术后不会复发，只能说经验丰富的手术医生复发率低。那么肛瘘复发的因素有哪些呢？

1.术中遗漏肛瘘瘘管。这种情况主要见于复杂性肛瘘，因为复杂性肛瘘瘘管较多，瘘管弯曲，手术时术者将肛瘘主瘘管切开后，没有发现分支瘘管，分支瘘管没有切除，手术后分支瘘管会发炎、流脓造成肛瘘复发。

2.肛瘘内口定位不准确。肛瘘手术成功与否关键是手术时是否寻找到正确的肛瘘内口以及充分切开内口。因为肛瘘感染的内口是肛瘘感染的源头，外口是肛瘘外在的破溃口。如果手术医生内口定位失败，术后肛瘘内口必然继续感染，随之造成肛瘘的复发。

3.术后切口假愈合。这种情况主要是术后换药不当造成的。术后换药对于肛瘘的治疗有着重要作用，如果医生术后换药引流不当或者病人不配合换药，肛瘘切口的两侧创缘皮肤很容易黏连在一起，再加上处理不及时，肛瘘的基底部创面并没有被肉芽填充完全，这样的愈合就是桥型愈合，假愈合。由于不是真的愈合，皮下是空腔，继而感染复发。

4.主瘘管未切开。医生在手术时或没有找到主瘘管或者顾忌损伤肛门括约肌影响肛门功能而未能充分敞开主瘘管，结果创面一直不能愈合，或即使愈合后又感染溃破复发。5.盲目制造人为内口。经验不丰富的医生未寻找到正确的内口，强行用探针制造内口，必然复发。