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目前对于新型冠状病毒肺炎的确诊主要有赖于病毒的核酸检测，这一点在诊断新型冠状病毒肺炎方面属于金标准，虽然也有人将CT最为诊断标准，但比起核酸检测，还是不能拿来当金标准使用的。

但目前就核酸检测来说，尚存在一定的局限性，其诊断价值还未达到百分之百的效率，尤其在“假阴性”（假阴性即为患者确有感染，但是结果未检测出感染，提示阴性，即为假阴性）上的比例上并不低。很多人也会好奇，既然是特异性的检查，怎么会有假阴性的情况出现。

其实这个问题的原因主要有两个，一方面与目前病毒核酸检测试剂盒的技术尚未十分完善有关，毕竟疫情的发生实施料不及的，对于这个病毒的认识我们也是才开始进行的，因此相关的检测技术肯定是有待于进一步升级和提高的；另一方面与采集的患者的分泌物是相关的，很多假阴性的结果都发生在感染早期，病毒藏得比较深，比如藏在气道内或者终末支气管内，而这个时候检测咽喉部的分泌物肯定很难找到病毒的踪迹，因此专家也建议有条件的话还是要尽量采集深部分泌物，以提高检出效率和比例。

除此之外，对于病毒的检测还有二代基因测序的方法可以采用，这个检测方法阳性率更高，假阴性更低，但是鉴于该检查较为繁琐，而且成本也比较高，同时技术上也存在一定的局限性，因此并没有投入大规模投入常规检查当中。