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艾滋病的发病过程比较漫长，临床上将这个漫长的潜伏带毒过程分为四期：急性感染期、无症状感染期、艾滋病前期、典型艾滋病期。
1.急性感染期 急性感染期主要是指感染者初次感染HIV的2~4周。感染者可能会出现发热、皮疹、淋巴结肿大，还会发生乏力、出汗、恶心、呕吐、腹泻、咽炎、神经系统症状等。做检查时，血液中血液中可检出HIV-RNA和P24抗原，而HIV抗体则在感染后数周才出现，CD4+T淋巴细胞计数一过性减少，CD4/CD8比率明显倒置。这些表现常较轻微，容易被忽略，持续半个月左右后自然消失。
2.无症状感染期 无症状感染期，对于成人感染者来讲，有些感染者持续时间为6-8年，也有感染者为2～10年或更长，儿童感染者潜伏期短，平均为12个月。此阶段感染者不会出现任何症状，但HIV在感染者体内持续繁殖，CD4+T细胞计数逐渐下降，具有传染性。 潜伏期内的感染者用敏感方法可检测病毒载量，预测5年内发病的几率。
3.艾滋病前期 此期有很多命名，包括"艾滋病相关综合征"、"淋巴结病相关综合征"、"持续性泛发性淋巴结病"、"艾滋病前综合征"等，为无症状感染期之后，开始出现与艾滋病有关的症状和体征，直至发展成典型的艾滋病的一段时间。 患者已出现细胞免疫缺陷的情况，只是症状较轻而已。主要表现为持续性的淋巴腺肿大，开始于颈部，其次为腋、腹股沟淋巴结等，一般至少有两处以上淋巴结肿大。特点是淋巴结肿大直径在1cm以上，质地柔韧，无压痛，无粘连，能自由活动，一般持续肿大3个月以上。此外，还可能出现肌肉疼痛、体重减轻10%以上、持续数月的周期性发热、夜间盗汗、头痛、抑郁或焦虑，以及发生单纯疱疹病毒、白色念珠菌等各种感染。
4.典型艾滋病期 此期是艾滋病病毒感染的最终阶段，由于免疫系统被严重破坏，患者极易发生严重的细胞免疫缺陷、 各种致命性机会性感染、各种恶性肿瘤，出现各种严重的综合病症，病变可表现在肺、口腔、消化系统、神经系统、内分泌系统、心脏、肾脏、眼、关节、皮肤等等。已发生机会性感染者，平均存活期为9个月。